MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN04

Total Repeats: 276

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010633	AGT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010633	T	6	6	26	31	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010633	ATT	2	6	168	173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010633	AAT	2	6	178	183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010633	CTT	2	6	190	195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010633	GAT	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010633	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010633	GATA	2	8	314	321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010633	T	6	6	378	383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010633	AAAT	2	8	405	412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010633	AAT	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010633	GGT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010633	GTT	2	6	496	501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010633	A	7	7	507	513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010633	T	7	7	534	540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010633	TTTG	2	8	604	611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010633	CT	3	6	628	633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010633	ATAA	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010633	A	6	6	680	685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010633	TGA	3	9	692	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010633	CAG	2	6	773	778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010633	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010633	TTAC	2	8	943	950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010633	ATA	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010633	AT	3	6	1083	1088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010633	T	6	6	8765	8770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010633	CCA	2	6	12396	12401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010633	TAA	2	6	13425	13430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010633	CTA	2	6	13445	13450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010633	CAAA	2	8	13468	13475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010633	GT	3	6	13525	13530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010633	CAGTG	2	10	13605	13614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010633	GAA	2	6	13632	13637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010633	CAA	2	6	13648	13653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010633	GAT	2	6	13680	13685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010633	CTTG	2	8	13723	13730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010633	GTT	2	6	14806	14811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010633	TGA	2	6	14821	14826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010633	GA	3	6	16391	16396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010633	TCA	2	6	16414	16419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010633	GTT	2	6	16433	16438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010633	AG	3	6	16483	16488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010633	GAA	2	6	16972	16977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010633	CTG	2	6	17061	17066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010633	TATT	2	8	17088	17095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010633	GTG	2	6	17103	17108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010633	TTGA	2	8	17176	17183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010633	TGA	2	6	17197	17202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010633	AAATT	2	10	17207	17216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010633	TAA	2	6	17251	17256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010633	T	7	7	17348	17354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010633	ATT	2	6	17363	17368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010633	TAGT	2	8	17495	17502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010633	AAAAC	2	10	17593	17602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010633	AAT	2	6	17611	17616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010633	ATCA	2	8	17955	17962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010633	ATT	2	6	17965	17970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010633	TAG	2	6	17984	17989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010633	A	7	7	19154	19160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010633	GATT	2	8	19271	19278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010633	GCG	2	6	19290	19295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010633	T	6	6	19328	19333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010633	ATA	2	6	19393	19398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010633	GTC	2	6	19465	19470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010633	TTAC	2	8	19538	19545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010633	AGC	2	6	20273	20278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010633	AGTT	2	8	20300	20307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010633	TTAGT	2	10	21658	21667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010633	TAG	2	6	22281	22286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010633	GAA	2	6	22300	22305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010633	CTT	2	6	22649	22654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010633	CCA	2	6	22680	22685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010633	CT	3	6	22823	22828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010633	ATTC	2	8	22895	22902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010633	T	7	7	22936	22942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010633	CGC	2	6	22978	22983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010633	ATT	2	6	23533	23538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010633	TAA	2	6	23551	23556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010633	TGC	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010633	CAC	2	6	23721	23726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010633	GAA	2	6	26265	26270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010633	C	6	6	26291	26296	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_010633	CT	3	6	26323	26328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010633	TCTG	2	8	26329	26336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010633	GCG	2	6	27512	27517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010633	TCA	3	9	27571	27579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010633	CAA	2	6	27594	27599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010633	CT	4	8	27610	27617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010633	GA	3	6	27653	27658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010633	GTG	2	6	27698	27703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010633	GTT	2	6	27715	27720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010633	ATG	2	6	27740	27745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010633	CTG	2	6	28362	28367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010633	CAATT	2	10	28414	28423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010633	TAGG	2	8	28429	28436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010633	GAT	2	6	29593	29598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010633	TTC	2	6	29613	29618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010633	TTG	2	6	29710	29715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010633	CAT	2	6	29741	29746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010633	CAT	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010633	CTA	2	6	30037	30042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010633	TAA	2	6	30060	30065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010633	ATT	2	6	30130	30135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010633	TAAT	2	8	30962	30969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010633	A	6	6	31032	31037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010633	AGA	2	6	31080	31085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010633	TCC	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010633	GGA	2	6	31126	31131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010633	TAC	2	6	34388	34393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010633	CTT	2	6	34482	34487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010633	TAC	2	6	34631	34636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010633	CGT	2	6	35147	35152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010633	ATC	2	6	35296	35301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010633	TTA	2	6	36421	36426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010633	AG	4	8	36466	36473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010633	ATTT	2	8	36479	36486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010633	AAAT	2	8	36509	36516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010633	CTA	2	6	36517	36522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010633	A	6	6	36553	36558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010633	A	6	6	36568	36573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010633	TA	3	6	36577	36582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010633	GCA	2	6	36639	36644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010633	T	6	6	36782	36787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010633	GTC	2	6	36825	36830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010633	TTC	2	6	38640	38645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010633	AAT	2	6	38664	38669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010633	TAT	2	6	38692	38697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010633	TGT	2	6	38702	38707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010633	GTT	2	6	38758	38763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010633	TAA	2	6	38769	38774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010633	TAAA	2	8	38810	38817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010633	AAT	2	6	39917	39922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010633	CGT	2	6	39935	39940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010633	GAC	2	6	40090	40095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010633	CCCG	2	8	40163	40170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_010633	A	8	8	40931	40938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010633	TCC	2	6	40968	40973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010633	T	6	6	41127	41132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010633	ATA	2	6	41133	41138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010633	TAAT	2	8	41149	41156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010633	T	6	6	41185	41190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010633	T	6	6	42213	42218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010633	TCGG	2	8	42264	42271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010633	CG	3	6	42295	42300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010633	ATGA	2	8	42309	42316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010633	TGT	2	6	42386	42391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010633	TAT	2	6	42423	42428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010633	ATT	3	9	42477	42485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010633	TAA	2	6	42490	42495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010633	TCC	2	6	42528	42533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_010633	CAG	2	6	42632	42637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010633	TAC	2	6	42776	42781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010633	GTA	2	6	42786	42791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010633	GAA	2	6	42820	42825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010633	T	9	9	42835	42843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010633	AGA	2	6	42863	42868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010633	AGCA	2	8	42916	42923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_010633	TGTT	2	8	43468	43475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010633	TG	3	6	43492	43497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010633	AAT	2	6	43522	43527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010633	CGA	2	6	43608	43613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_010633	ATT	2	6	43628	43633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010633	A	6	6	43688	43693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010633	GTT	3	9	43703	43711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010633	CTG	2	6	43735	43740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_010633	CAG	2	6	43751	43756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_010633	AAAGA	2	10	43821	43830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010633	AAAG	2	8	45164	45171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_010633	GTT	2	6	45277	45282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010633	TTTCA	2	10	45358	45367	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_010633	AGC	2	6	45397	45402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_010633	TTA	2	6	45509	45514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010633	TTTA	2	8	45517	45524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010633	CCT	2	6	45612	45617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_010633	TA	4	8	45727	45734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010633	TAG	2	6	49761	49766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010633	TCT	2	6	49774	49779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_010633	TGA	2	6	49846	49851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010633	TAAA	2	8	49919	49926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010633	AAT	2	6	49951	49956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_010633	TGA	2	6	50146	50151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_010633	TCA	2	6	50261	50266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_010633	CTC	2	6	50701	50706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_010633	ATT	2	6	50789	50794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_010633	AT	3	6	61649	61654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_010633	A	6	6	61666	61671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010633	GA	3	6	61678	61683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_010633	AAC	2	6	61691	61696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_010633	TA	3	6	62619	62624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_010633	AGA	2	6	62696	62701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.